Class: MedPipe::PipelineTask::TsvGenerater

Inherits:
Object
  • Object
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Defined in:
lib/med_pipe/pipeline_task/tsv_generator.rb

Constant Summary collapse

TSV_OPTION = 
{ col_sep: "\t" }.freeze

Instance Method Summary collapse

Instance Method Details

#call(_context, lines) {|生成したtsvファイル| ... } ⇒ Object

Parameters:

  • lines (Enumerable<Array<Object>>) —

    to_s可能なオブジェクトの配列のEnumerable

Yield Parameters:

  • 生成したtsvファイル (File) 


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# File 'lib/med_pipe/pipeline_task/tsv_generator.rb', line 10

def call(_context, lines)
  Tempfile.create do |file|
    lines.each do |line|
      # nil に置き換えることで""という文字列が出力されてしまうのを回避
      normalized_line = line.map { |v| v == "" ? nil : v }
      tsv_line = CSV.generate_line(normalized_line, **TSV_OPTION)
      file.puts(tsv_line)
    end
    file.rewind

    yield(file)
  end
end