Method List

Classes Methods Files

Search:

#alternatives Bio::DB::Vcf
#calculate_clusters Bio::Util::Gngm
#calculate_densities Bio::Util::Gngm
#calculate_signal Bio::Util::Gngm
#close Bio::Util::Gngm
#clusters Bio::Util::Gngm
#collect_threads Bio::Util::Gngm
#densities Bio::Util::Gngm
#discordant_chastity Bio::DB::Pileup
#draw_bands Bio::Util::Gngm
#draw_hit_count Bio::Util::Gngm
#draw_peaks Bio::Util::Gngm
#draw_signal Bio::Util::Gngm
#draw_threads Bio::Util::Gngm
#each Bio::DB::FastaLengthDB
#file Bio::Util::Gngm
#frequency_histogram Bio::Util::Gngm
#get_band Bio::Util::Gngm
#get_insert_size_frequency Bio::Util::Gngm
#get_peaks Bio::Util::Gngm
#get_unmapped_mate_frequency Bio::Util::Gngm
#gq Bio::DB::Vcf
#hit_count Bio::Util::Gngm
#initialize Bio::Util::Gngm
#initialize Bio::DB::FastaLengthDB
#is_allowed_substitution? Bio::Util::Gngm
#is_indel? Bio::DB::Vcf
#is_mnp? Bio::DB::Vcf
#is_snp? Bio::DB::Vcf
#is_snp? Bio::DB::Pileup
#keep_known_variants Bio::Util::Gngm
#mq Bio::DB::Vcf
#non_ref_allele_count Bio::DB::Vcf
#non_ref_allele_freq Bio::DB::Vcf
#pass_quality? Bio::DB::Vcf
#peaks Bio::Util::Gngm
#pl Bio::DB::Vcf
#second_non_ref_count Bio::DB::Pileup
#signal Bio::Util::Gngm
#snp_positions Bio::Util::Gngm
#snp_positions= Bio::Util::Gngm
#third_non_ref_count Bio::DB::Pileup
#threads Bio::Util::Gngm
#to_s Bio::DB::Vcf
#top_non_ref_count Bio::DB::Pileup
#used_depth Bio::DB::Vcf
#variant? Bio::DB::Vcf