Libraries
»
bio-maf
(1.0.1)
»
Documentation for bio-maf (1.0.1)
Alphabetic Index
File Listing
README
bgzf
block-joining
dir-access
gap-removal
maf-indexing
maf-output
maf-parsing
maf-querying
maf-to-fasta
slice
tiling
ucsc-bins
LICENSE
DEVELOPMENT
Namespace Listing A-Z
Top Level Namespace
A
Access
(Bio::MAF)
AllSpeciesFilter
(Bio::MAF)
AtLeastNSequencesFilter
(Bio::MAF)
B
BGZFChunkReader
(Bio::MAF)
Bio
BioMaf
Block
(Bio::MAF)
C
ChunkReader
(Bio::MAF)
CompletionTracker
(Bio::MAF)
D
DummyExecutor
(Bio::MAF)
DummyParser
(Bio::MAF)
E
EmptySequence
(Bio::MAF)
Executor
(Bio::MAF)
F
FASTARangeReader
(Bio::MAF)
FASTAWriter
(Bio::MAF)
Filter
(Bio::MAF)
Filters
(Bio::MAF)
ForkRunner
(Bio::MAF)
G
GenomicInterval
(Bio)
H
Header
(Bio::MAF)
J
JExecutor
(Bio::MAF)
JThreadRunner
(Bio::MAF)
JobRunner
(Bio::MAF)
K
KEY
(Bio::MAF::KVHelpers)
KVHelpers
(Bio::MAF)
KyotoIndex
(Bio::MAF)
M
MAF
(Bio)
MAFParsing
(Bio::MAF)
MaxSizeFilter
(Bio::MAF)
Member
(Bio::MAF)
MinSizeFilter
(Bio::MAF)
P
ParseContext
(Bio::MAF)
ParseError
(Bio::MAF)
Parser
(Bio::MAF)
S
Sequence
(Bio::MAF)
Struct
(Bio::MAF)
T
ThreadedChunkReaderWrapper
(Bio::MAF)
Tiler
(Bio::MAF)
U
Ucsc
(Bio)
UcscBin
(Bio::Ucsc)
V
VAL
(Bio::MAF::KVHelpers)
W
Writer
(Bio::MAF)